Emilia Isobel Euphemia Rose Clarke, 23 Ekim 1986 tarihinde Londra, İngiltere'de dünyaya gelmiş ve Berkshire ile Oxfordshire'da büyümüştür. Tiyatro ses mühendisi bir baba ve iş insanı bir annenin kızı olan Clarke, oyunculuk tutkusunu henüz üç yaşındayken babasının çalıştığı "Show Boat" müzikalini izledikten sonra keşfetti. Oxford'daki St Edward's School'dan sonra, Colin Firth ve Tom Hardy gibi isimlerin de mezun olduğu prestijli Drama Centre London'da eğitim aldı ve 2009 yılında mezun oldu.
Profesyonel kariyerine "Doctors" dizisindeki konuk oyunculuğu ve 2010 yapımı "Triassic Attack" adlı televizyon filmiyle başladı. Screen International dergisi tarafından "Yarının Birleşik Krallık Yıldızları" arasında gösterildi. Ancak hayatını tamamen değiştiren ve onu küresel bir fenomene dönüştüren olay, HBO'nun efsanevi dizisi "Game of Thrones"un (2011-2019) deneme çekimlerinde, Daenerys Targaryen rolünü kazanması oldu. Pilot bölümde rol alan oyuncunun yerine kadroya dahil olan Clarke, sürgündeki bir prensesten "Ejderhaların Annesi"ne ve güçlü bir fatihe dönüşen karakteriyle unutulmaz bir performans sergiledi. Bu rolüyle dört kez Primetime Emmy Ödülü'ne aday gösterildi ve Time dergisinin "Dünyanın En Etkili 100 Kişisi" listesine (2019) girdi.
"Game of Thrones" devam ederken Clarke, Hollywood'un büyük bütçeli serilerinde de yer alarak çok yönlülüğünü kanıtladı. "Terminator Genisys" (2015) filminde ikonik Sarah Connor karakterini canlandırdı. Ancak aksiyon dışındaki yeteneğini asıl kanıtladığı yapım, Jojo Moyes'in romanından uyarlanan ve Sam Claflin ile başrolü paylaştığı romantik drama "Senden Önce Ben" (Me Before You) (2016) oldu. Filmdeki Louisa Clark performansı, gişede büyük başarı yakaladı ve ona geniş bir hayran kitlesi kazandırdı. 2018 yılında "Star Wars" evrenine katılarak "Han Solo: Bir Star Wars Hikayesi" filminde Qi'ra karakterine hayat verdi.
Dizi sonrasında kariyerini tiyatro ve sinemayla dengeli bir şekilde sürdürdü. 2019 yapımı romantik komedi "Bir Şans Daha" (Last Christmas) filminde başrol oynadı. Tiyatroda ise Broadway'de "Breakfast at Tiffany's" (2013) ve West End'de Anton Çehov'un "Martı" (The Seagull) (2020/2022) oyunundaki Nina rolüyle sahne aldı. Yakın dönemde Marvel Sinematik Evreni'ne dahil olarak "Secret Invasion" (2023) dizisinde G'iah karakterini canlandırdı.
"Game of Thrones"un ilk sezonlarında geçirdiği iki beyin anevrizması sonrasında hayatta kalan Clarke, bu deneyiminden yola çıkarak beyin hasarı geçiren gençlere yardım etmeyi amaçlayan "SameYou" adlı hayır kurumunu kurdu. Bu alandaki çalışmaları nedeniyle 2024 yılında annesiyle birlikte Britanya İmparatorluk Nişanı (MBE) ile onurlandırıldı.
